东吴之主孙权的首次正式登场，是在游戏推进到柴桑城章节。玩家在经历博望坡之战、携民渡江等一系列事件后，会抵达位于荆州东南方向的江夏城，并与孔明一同乘船前往柴桑。进入柴桑城的宫殿，与周瑜、鲁肃等东吴重臣进行关键对话后，孙权便会现身。他的出现标志着剧情正式进入赤壁之战篇章，他会亲自委托玩家（以孔明为代表）解决三个难题，以此作为孙刘联盟共同抗曹的前提。寻找孙权的确切关卡就是柴桑城的宫殿内，这是他推动后续宏大剧情的起点。
见到孙权后，游戏接下来的核心流程便围绕他三大难题展开。这三大难题分别是借东风、献连环计和造百万支箭，玩家必须逐一完成才能推动联盟成立。借东风需要前往日本击败大蛇取得秘法书；献连环计则要在柴桑城南面的湖泊附近找到隐士庞统；而造百万支箭最为繁琐，需先在柴桑城东南山洞取得硝石，再在城中老树下找到老树枝，合成火药后炸开博望坡的岩石，进入襄阳城地下室取得百万支箭。只有将这些任务物品带回柴桑城复命，孙权才会认可玩家的能力，并同意共同发起赤壁之战。
完成所有前置任务后，返回柴桑城与孙权对话，即可触发历史上著名的赤壁之战。这是游戏前期一场关键且宏大的战役。在此战中，玩家需要确保孔明在出战队伍中，并最好将其设为军师。战斗开始后，选择使用道具指令，让孔明使用之前取得的秘法书发动火攻，便能对曹操大军造成毁灭性打击，从而顺利赢下这场战役。若未携带孔明或忘记使用秘法书，战斗将变得异常艰难。此战的胜利，直接得益于孙权所提供的平台与资源，是孙刘联盟合作的直接成果。
赤壁之战胜利后，孙权在主线剧情中的直接互动会暂时减少，但其影响力依旧贯穿后续章节。在剧情推进到平定荆南四郡时，攻打长沙城等地的过程中，孙权会作为背景势力，派遣东吴将领如吕蒙、陆逊等驻守相关关卡，与玩家队伍进行对抗。此时玩家虽无法再与孙权直接对话，但他的军事部署依然是游戏进程中的重要障碍，玩家需要击败他的部将才能继续完成平定荆州的任务。
孙权会再次作为核心对手出现。当玩家平定西川、北伐中原之后，最终需要率军攻打东吴的根据地建业城。玩家将与孙权展开最终对决。这场战斗的难度极高，通常要求玩家队伍的平均等级达到较高级别，并合理搭配关羽、赵云等顶级武将和强力计策。击败建业城的孙权后，将会触发其投降的剧情，标志着东吴势力的瓦解，整个游戏也接近尾声。孙权的戏份贯穿了游戏中后期，从赤壁的盟友到最终的对手，构成了完整的剧情线索。
